El Tribunal Supremo ha tomado una decisión contraria a la petición de la Fiscalía. La Audiencia Nacional dejará la investigación sobre los políticos del Govern excepto los casos por sedición contra el mayor de los Mossos d'Esquadra, Josep Lluís Trapero y la jefa de los mossos, Teresa Laplana. También seguirá siendo responsable de la investigación a miembros del Govern que puedan ser investigados en el futuro, de categoría inferior a la de conseller.
La unificación del procedimiento tiene una "finalidad funcional". Se espera facilitar la tramitación y evitar posibles problemas por el enjuiciamiento de causas tan similares en distintos organismos. Concretamente se refiere al delito de rebelión, que tiene una pluralidad de partícipes. Sin embargo, diferencia entre el caso de los miembros del Govern y de los presidentes de ANC y Ómnium y considera que solo si actuaron juntos tendría cabida la posibilidad de un delito de rebelión.